GI |
3688533  |
Accession |
AJ006678 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Polyporaceae ; Skeletocutis ; Skeletocutis kuehneri
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Sequence |
ATTGTATTATCAAATCCCTTCATTCTTGTGAAGTGGGTATTGGATTTGGAGGTCTTTGCGGGTTTCACTGTAAATCTGCTCCTCTTGAATACATTAGCTAGAAACCTTTTGTTAGGCTGGCTTCAGTGTGATAATTGTCTGCGCTGTAGTCGTCTAGCACTTGTATAAAGGATTTTGCTTCTTAATCGTCTTTTCTTAAGACAATCTTGACATCT |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-22.9 kcal/mol |
Model |
18028196 |
Alignment |
Sbjct: ATTAAATTCTCAACCTTACTAGCTTTTGCTATGTAATGGCTTGGATATGGGGGTCTTTTGCTGGTTTCGAAAGGAATCTGCTCCCCTTAAATGCATTAGCCGGTGCCCCGC--GTGGACCGTCTATTGGTGTGATAA-TATCTACGCCGTTAGACGTCTG--CTTTAAATGGGTTGTGCTGCTTC-TAATCGTC--CTCTTAGGACAATTATTGACCATTTGA .........((((((((((((((....)))).)))).)).))))....(((((......((.((((((....)))))).)).))))).......(((((.((((((((((.--((((((.(((((.(((((((((..-.))).)))))).))))))))))--)......))))..))))))...)-)))).(((--((...)))))................. Query: ATTGTATTATCAAATCCCTTCATTCTTGTGAAGTGG-GTATTGGATTTGGAGGTC-TTTGCGGGTTTCACTGTAAATCTGCTCCTCTTGAATACATTAGCTAGAAACCTTTTGTTAGGCTGGCT-TCAGTGTGATAATTGTCTGCGCTG-TAGTCGTCTAGCACTTGTATAAAGGATTTTGCTTCTTAATCGTCTTTTCTTAAGACAATC-TTGACATCT--- .........((((((((.(((((....)))).).))-)).))))....(((((..-...((.(((((......))))).)).))))).......(((((.(((((...(....((((((.((((-.(((((((((....))).))))))-.)))))))))..).......).....)))))...).)))).(((..((...)))))....-.........--- CBCs: _____________(_((___((______))____))__)___________(_________________________________)__________________(____(____(_______(_____(___________________)_____)________)_______)______)__________________(_____)____________________ HCBCs: ______________(___(___(____)____)____)____________________________(______)__________________________(((_(_________((_(________(____(__(____)___)____)_______)_))________________)_)))__________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 92.857 II: 92.308 III: 85.714 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 416
End: 630 |