| GI |
3688569  |
| Accession |
AJ006671 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Polyporaceae ; Spongipellis ; Spongipellis spumeus
|
| Sequence |
ATGGTATTCTCAATTCCTTTGATTTCTTTCCACGGGATCAAAGAGATATTGGATTTGGAGGCTCTCATTGCCGGCGTATCGTCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGTGAATAGACATACCCGATATTCTCCAGCGTGATAATTATCTGCGCTGTTGAAGGGGTTGCATATATCGCATGCTTCAAATGGTCTCTTCATTGAGACAATTTTATTTTGACATCTGA |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-17.6 kcal/mol |
| Model |
300077905 |
| Alignment |
Sbjct: ATGGTATTCTCAACTCCCTAAATCTTTGC-----GGATTTGGGTGA-GTTGGATGTGGAGG---TGATTGCTGGCGTGCATTAGTTTGCGTTGTCGGCTCCTCTGAAATAAATTAGCGGAAATG---TTGCCGTGTCAACCTCAGTGTGATAATTGTCTACGCTGTTGTTGCTCTGCAAAATATATGTTTCCGCTTCAAATCGTC------TTCGGACAATT---TCTTGACATCTGA
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CBCs: _____________(___(_((_________________))_)_____)______________________________________________________________________((_________(_______((_____________________________))______)____________))_______________________________________________
HCBCs: __________________(____(___________)____)______________________________(___(_______________)___)_____________________(_____(_____________________(_(__(____)___)_)_______________________)_____)______________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 100
II: 80
III: 75
IV: 100
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| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 399
End: 621
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