| GI |
38455345  |
| Accession |
AY456339 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; Clavulina ; Clavulina cinerea
|
| Sequence |
ATTAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCCTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGCGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTATAGACCTGGTCTTGCAGATTGTTCAATCTGTGGCTCCACTTTTCAGCT |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-8.7 kcal/mol |
| Model |
158934561 |
| Alignment |
Sbjct: -ATGAAATCTTCAA-CTTACA-GACCTTTGCG--GGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTC--GGCCGTGTTTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGTATTAGCTTGATTCCTTGCGG-ATCGGCT---CTCGGTGTGATAAT-GTCTA--CGCCGCGACCGTGAAGTGTTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTTGTGAGACAGC---------------------------------------
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Query: ATTAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCCTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGCGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTATAGACCTGGTCTTGCAGATTGTTCAATCTGTGGCTCCACTTTTCAGCT
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CBCs: ___________________(___________________)_______________(_(_________(__(_____)__)_____)_)________________(_______________(__________(_____________________)______)______________)____________(__(______)__)___________________________________________
HCBCs: __________________(___((____________))__)_____________________(___________________)__________________(______________________(________(_(___________)___)_____)____________________)___________(________)_____________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 75
II: 84.615
III: 82.609
IV: 80
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| Annotation |
Process: Mixed HMM and Genbank annotation
Start: 392
End: 636
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