GI |
397933  |
Accession |
X70028 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Russulales ; Bondarzewiaceae ; Heterobasidion ; Heterobasidion araucariae
|
Sequence |
GTGAAATTCTCAACCCTGTGCTTTTCTTGTGAAAGTGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTTGCTGGTCCCTCGTGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGTGAACCCTTGTGGTGCCGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGTGGTGCGCCGCGATTGTGGGGGGACCCGCTTCCAACCGTCGAAAGACAACTTTATCGAAACTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-41.5 kcal/mol |
Model |
76786575 |
Alignment |
Sbjct: GTGAAATTCTCAACCCCGT--CTTCTTTYTTGAAGAGCGGAGG-TTGGACTTGGAGGTCGTTGCCGGTCCTTTTGTGATCGGCTCCTCTGGAATGCATTAGCGAG-ACCCTTGCGGTGGCG-CCTTGGTGTGATAATTGTCTACGCCATG--GACGTGCCGCGATTTCATGGGGCGCTCGCTTCGAACCGTCGCAAGACACTTTCATCGAACC---- .........((((((((((--((((......))))).))).))-))))..(((((((.....(((((((.......))))))).)))))))........((((((-.(((((((((((.((-((.(((((((((....))).)))))).)--).))))))))))......)))...))))))((((...(((....))).......))))...---- Query: GTGAAATTCTCAACCCTGTGCTTTTCTTGTGAAAGTGCGTGGGCTTGGACTTGGAGG-CTTTGCTGGTCCCTCGTGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGTGAACCCTTGTGGTGCCGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGTGGTGCGCCGCGATTGTGGGGGG-ACCCGCTTCCAACCGTCGAAAGACAACTTTATCGAAACTTGA .........((((((.((...((((......))))..))..)).))))..(.(((((-....(((((((.......))))))).))))).)........((((.(..(((((((((((.((.((.(((((((((....))).)))))).)..).))))))))))......))).-.).))))((.(...(((....))).......).))....... CBCs: ________________________(______)_____________________________________________________________________________________________(_____________________)_____________________________________________________________________ HCBCs: ________________(____(____________)___)___________(_____________(_______________)_________)______________________(___(__(_________________________________)_)___)________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 85.714 II: 92.857 III: 96.667 IV: 85.714 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 376
End: 590 |