GI |
40644225  |
Accession |
AJ419220 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetidae ; Boletales ; Suillineae ; Suillaceae ; Suillus ; Suillus tridentinus
|
Sequence |
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTCGCTTCGATAGGGCGTTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGACCTCGACTTTTCGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGAATAGGCTTGCGGTCGGCTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTCGGCGTGATAATGATCGTCGTATGCTGAAGTGCATGAATGAACGTCCGTGCCTCTAATGCGTCGATGCCTTCGGGCGTCTTCTTTATTGACTTTT |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-58.1 kcal/mol |
Model |
176063 |
Alignment |
Sbjct: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAAAGGGTGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGATCTGGACTTCTCGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGAATGGGCCTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCTGAAGTGCATGAATGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGTGTCGATGCCTTCTGGCGTCTTCCTTATTGACTTTTGA .........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(((((((.....))))))).))).))).))))).........((((..((((..((((((((..(((((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))))..)))).)))))))))))).(((((....((((((....)))))).....)))))........ Query: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTCGCTTCGATAGGGCGTTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGACCTCGACTTTTCGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGAATAGGCTTGCGGTCGGCTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTCGGCGTGATAATGATCGTCGTATGCTGAAGTGCATGAATGAACG--TCCGTGCCTCTAATGCGTCGATGCCTTCGGGCGTCTTCTTTATTGACTTTT-- .........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(((.(((.....))).))).))).))).))))).........((((..((((..(..(((((..(((((((.....(((.....(((((((....)))).)))..)))...)))))))..)))).)--))))))))).(((((....((((((....)))))).....)))))......-- CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _________________________________________________________________(_________________)_______________________(___________(_____________________________(_________________)_________________________)_______)____________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 94.444 III: 91.176 IV: 100 |
Annotation |
Process: Mixed HMM and Genbank annotation
Start: 372
End: 613 |