GI |
42661451  |
Accession |
AJ627593 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma australe
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Sequence |
AATCTTCAACTTACAAGCTCTTTGCGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCTTTAACGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTTCCTTGCGGATCGGCTGTCGGTGTGATAATGTCTACTCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCCCGTTACAGAGACAGCTTTA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-41.6 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGG-TTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((.-.(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......))))).................. Query: ----AATCTTCAACTTACAAGCTCTTTGCGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGG--CCTTTAACGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTTCCTTGCGGATCGGC-TGTCGGTGTGATAATGTCTACTCCGCGACCGTGAAGCG---TTTGGCAAGCTTCTAACCGTCCCGTTACAGAGACAGCTTTA----------- ----((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((--((......))))))).)))))..........((((((...((..(((....(((.-((.(((.(((((...))).)).))))).)))....)))---...)))))))).......(((.(......).))).......----------- CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________((_____(__((____))__)_____))___________________________________________________________(___________________________________________________________________)_____________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 92.308 III: 88.889 IV: 80 |
Model for |
root

| cellular organisms

Eukaryota

Fungi/Metazoa group

Fungi

environmental samples

uncultured fungus

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| Dikarya

Basidiomycota

Agaricomycotina

Agaricomycetes

Agaricomycetidae

Agaricales

Hygrophoraceae

Hygrophorus

Hygrophorus olivaceoalbus

| unclassified Hygrophorus

Hygrophorus olivaceoalbus ectomycorrhiza S15

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| environmental samples

uncultured Hygrophorus

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Annotation |
Process: Genbank annotation
Start: 1
End: 193 |