GI |
474120  |
Accession |
X78773 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma formosanum
|
Sequence |
AATCTTCAACCTACAAGGTCTTTGTAAAGGCTTTTNAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTATAGGTCGGCTCCTCTTAAACGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGTTTGTCGGTGTGATAACGTCTACGACGCGACCGTGAAGCGTTTTGGCAAGCTTCTAACGGTCTCTGTATGGAGACAAAGCTTA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-38.5 kcal/mol |
Model |
186703615 |
Alignment |
Sbjct: AATCTTCAACCTATAA-ACCTTTGC--GGGTTTATCAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCCAGGTGGTGTCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTC-TCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCG-TTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTC-GCAT-GAGACAATTCATTGACCTC ....((((((((((((-((((....--)))))))).))).)))))...(((((...((((((((....)).)))))).)))))..........((((((...((.(((....(((.((-.(((((((((....))).)))))).)))))....)))-...)))))))).......(((((-....-))))).............. Query: AATCTTCAACCTACAAGGTCTTTGTAAAGGCTTTTNAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTATAG-GTCGGCTCCTCTTAAACGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGTTTGTCGGTGTGATAA-CGTCTACGACGCGACCGTGAAGCGTTTTGGCAAGCTTCTAACGGTCTCTGTATGGAGACAAAGCTTA------ ....(((((((((.((.((((......)))))).).))).)))))...(((((...((((((((....))-)))))).)))))..........((((((...((.(((....(((.((..((.((((((..-.))).))).)).)))))....)))....)))))))).......(((((......)))))........------ CBCs: _________________(____________)________________________________(____)________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: __________________(_(______)_)_______________________________(_________)_________________________(___________________(__________________________)__________________)_________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 93.75 II: 100 III: 96 IV: 100 |
Annotation |
Process: Genbank annotation
Start: 7
End: 203 |