GI |
474149  |
Accession |
X78768 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma tsugae
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Sequence |
AATCTTCAACCTACAAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGNGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGNCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAAGACAGCTTTA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-46.5 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......))))).................. Query: ----AATCTTCAACCTACAAGCTTT---TGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGG--CCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGNGGATCGGCTC-TCGGTGTGATAATGTCTACGNCGCGACCGTGAAGCG---TTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTAT----AAGACAGCTTTA----------- ----((..(((((((((((((((.(---.).)))))))))).))))).))(((((...(((((--(((....)))))))).)))))..........((((((..((..((.....(((.((-.((.((((((...))).))).)).))))).....))---...)))))))).......(((((..----))))).......----------- CBCs: ___________________________________________________________________(____)______________________________________________________________________________________________________________(______)______________________ HCBCs: _____________(______(___(____)___)______)_______________________________________________________________________________(_________________________)__________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 94.737 II: 100 III: 85.185 IV: 100 |
Annotation |
Process: Genbank annotation
Start: 7
End: 191 |