GI |
474155  |
Accession |
X78767 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma tsugae
|
Sequence |
AATCNTCAACCTACAAGCTTTTGTNGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCGCTGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTATAGACAGCTTTAT |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-37.3 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......))))).................. Query: ----AATCNTCAACCTACAAGCTTT---TGTNGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGG--CCGTTATCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTC-TCGGTGTGATAATGTCTACGCGCTGACCGTGAAGCG---TTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTAT-----AGACAGCTTTAT---------- ----((...(((((((((((((..(---.)..))))))))).))))..))(((((...(((((--(((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((....(((.((-...(((((((...))).))))...)))))....)))---...)))))))).......((((...-----))))........---------- CBCs: ___________________________________________________________________(____)____________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________(______(___(____)___)______)_______________________________________________________________________________(_________________________)__________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 84.211 II: 100 III: 85.185 IV: 80 |
Annotation |
Process: Genbank annotation
Start: 7
End: 191 |