GI |
474157  |
Accession |
X78769 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma tsugae
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Sequence |
AATCTTCAACCTACAAGCCTTTGCGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCCTTTGTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTCACTTGAAGACAGCTTTATGACCT |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-50.6 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......))))).................. Query: ----AATCTTCAACCTACAAGCCTT---TGCGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGG-CCCTTTGTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTC-TCGGTGTGATAATGTCTACG-CGCGACCGTGAAGCG---TTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTCACTTGAAGACAGC-TTTATGACCT---- ----((..(((((((((((((((.(---.).)))))))))).))))).))(((((...(((((-.((......))))))).)))))..........((((((..((..(((....(((.((-.((.((((((...))).)))-)).)))))....)))---...)))))))).......(((((......)))))...-..........---- CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________(______)______________________ HCBCs: _____________(______(_(_(____)_)_)______)_______________________________________________________________________________(_________________________)__________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 94.737 II: 92.308 III: 88.889 IV: 100 |
Annotation |
Process: Genbank annotation
Start: 7
End: 201 |