GI |
5070527  |
Accession |
AF145564 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Corticiales ; Corticiaceae ; Hyphodontia ; Hyphodontia radula
|
Sequence |
GTGAAATTATCAACTCCCTTTCTTTATTGAAGGGTGAGCTTTGGACTTGGGGATTGCTGGTGCAAATTGGCTTCCCTTGAATGTATTAGCTGGAATTTGATTCGCAGCATATATGCGGTGTGATAATGTCGTCACTGTGTAGCTCGGATTGTCTGGCTTCTAATCGTCCTTCACGGGACAATTTGATCTTTTTGACCTCAAATCAGGTAGG |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-54.6 kcal/mol |
Model |
183987112 |
Alignment |
Sbjct: GTGAAATTATCAACTCCCTTTCTTTATTGAAGGGTGAGC-TTGGATTTGGGGATTGCTGGTTTTCAATCGGCTTCCCTTGAATGCATTAGCTGGAATTTAATTCGCAGCATATATGCGGTGTGATAATGTCGTCACTGTGTAGCTCGGATTGTCTAGCTTCTAATCGTCCTTCACGGGACAATTTGATCAATT------------------- .........(((((((((((((......)))))).))).-)))).((.(((((..(((((((...))))))).))))).)).......(((((((...(((((((.(((...(((((((((((((...)))).))))))))))))))))))))))))))((.(((.(((((....))))).))).))......------------------- Query: GTGAAATTATCAACTCCCTTTCTTTATTGAAGGGTGAGCTTTGGACTTGGGGATTGCTGGTGCA-AATTGGCTTCCCTTGAATGTATTAGCTGGAATTTGATTCGCAGCATATATGCGGTGTGATAATGTCGTCACTGTGTAGCTCGGATTGTCTGGCTTCTAATCGTCCTTCACGGGACAATTTGATCTTTTTGACCTCAAATCAGGTAGG .........(((((((((((((......)))))).)))..))))..(.(((((..((((((...-.)))))).))))).)........(((((((...(((((((.(((...(((((((((((((...)))).))))))))))))))))))))))))))((.(((.(((((....))))).))).))......................... CBCs: ____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: __________________________________________________________(_________)______________________(_______(__________________________________________________)____)________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 85.714 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: Mixed HMM and Genbank annotation
Start: 354
End: 564 |