GI |
537964  |
Accession |
Z37087 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma fornicatum
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Sequence |
ATGAAATCATCAACCTAAAACCTTTGCGGTTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGNCCGTTCTTGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCNTCTAACGGTCTCAGTTGGAGACAGCTTTATGACCTCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-29.5 kcal/mol |
Model |
33325337 |
Alignment |
Sbjct: -----ATTCTCAACCTGCAAAGTGTAATGCTTTTGTAGGCTTGGATTTGGAGGCTTTCTTTGCTGGCC-TTGATGGTCAGCTCCTCTGAAATGCATTAGCTTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATATTTGTCTATGCCGTGACCGTTGAAGCGTTTTGGGCCAGCTTCTAATTGTCTT--TTGAAGACAGCTTTTGTTGACACT--- -----....((((((((((((((.....)).)))))))).)))).((((((((........(((((((-.....))))))).))))))))....(((((..(((((((..(((....(((.((.(((((((((....))).)))))).))))).....)))....)))))))...)))))((((..--..((((....))))....))))..--- Query: ATGAAATCATCAACCTA-AAACCTTTGCGGTTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGC-----TTGTCGNCCGTTCTTGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGC-TTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATA-ATGTCTACGCCGCGACCG-TGAAGCGTTT--GGCAAGCNTCTAACGGTCTCAGTTGGAGACAGCTTT--ATGACCTCTGA .........((((((((-(((((.....)).))).)))).))))..(.(((((.-----..((((.((......)).)))).))))).)......((((.-((.(((...(((....(((.((.(((((((((.-..))).)))))).)))))-....)))...--))).))...)))).((((......((((....))))--..))))..... CBCs: _____________________(_______)_________________________________(______________)_____________________________________________________________________________________________________(____________________________)_____ HCBCs: ________________(_____(_____)______)__________________________(________________)________________________________________________(_____________)________________________________________________(________)______________ |
Transferred percentage of helices |
I: 92.857 II: 80 III: 89.655 IV: 100 |
Model for |
root

| cellular organisms

Eukaryota

Fungi/Metazoa group

Fungi

Dikarya

Basidiomycota

Agaricomycotina

Agaricomycetes

Agaricomycetes incertae sedis

Polyporales

Ganodermataceae

Ganoderma

Ganoderma fornicatum

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Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 27
End: 228 |