GI |
538017  |
Accession |
Z37080 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma tsugae
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Sequence |
ATGASATCTTCAACCTACAAGCCTTTGCGGGTTTGNAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCCTTTGTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTCGCTTGAAGACAGCTTTATGACCTCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-38.9 kcal/mol |
Model |
5764500 |
Alignment |
Sbjct: ----AATCTTCAACTTACAGACCTTTGCGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTGTTTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTT-CGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGYGTTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCTCGTTTG--GACAGCTTTA---------- ----....((((((((((((((((....))))))))))).)))))...(((((...((((((((.....)))))))).)))))...........(((.(((..(((-(....(((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)))).)))..))).(((((((((.((....)).)))--)).))))...---------- Query: ATGASATCTTCAACCTACAAGCCTTTGCGGGTTTGNAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCCTTTGTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCG-TTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTCGCTTGAAGACAGCTTTATGACCTCTGA ........((((((((.(((((((....))))))).))).)))))...(((((...(((((((.......))))))).)))))...........(((.(.(..(((.(....(((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)))).)-)..))).(((((((((.((....)).)))..)).))))............. CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________(____((__________))____)________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 93.75 II: 92.308 III: 95.833 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 27
End: 231 |