| GI |
54299223  |
| Accession |
AY751563 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; unclassified Clavulinaceae ; cf. Clavulina sp. EC185 B92
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| Sequence |
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCATTTTTGTCCGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGCACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGCTTCACAGATTGTACAATTTGTGTTCCACATTTCAGCTTTGA |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-12 kcal/mol |
| Model |
51039043 |
| Alignment |
Sbjct: -ATGGAATTCTCAACTTATAA----ATCCTTGT-GATCTATAAGCTTGGACTTGGAGGCTTGCTG-GCCCTTGTCTGGT-CGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTACGG-ATCGGCT---CTCAGTGTGATAATTGTCTA--CGCTGTGACCGTGAAGTGTTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCATTAGGACAACTTTTTAACATCTGA----------------------------------------
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Query: GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCATTTTTGTCCGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGCACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCT--------CTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGCTTCACAGATTGTACAATTTGTGTTCCACATTTCAGCTTTGA
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CBCs: ______________((__((__________________))__))___________(_(___________________________)_)________________(_______________(_______________________________________)______________)____________(________)__________________________________________________________
HCBCs: __________________________(________)___________________________(__((_________))__)___________________________(____(_________(________(_(___________)___)_____)_________)_____)_______________(______)___________________________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 84.615
II: 83.333
III: 88.462
IV: 75
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| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 386
End: 633
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