| GI |
5453409  |
| Accession |
AF158017 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetidae ; Boletales ; Suillineae ; Rhizopogonaceae ; Rhizopogon ; Rhizopogon smithii
|
| Sequence |
AGTTAATTCATCAACCCCTCTCGATTAGGTTCGAGGGGGAGCTTGGATAGTGGGGGTTGCCGGAGACTTGGGACTACTAGTAGTTCCAGGACTCGGGCTCTCCTTAAATGCATTGGCTTGCGGTAGACTTTCGAGTTTGCGGGAAAAGGCTTTCGGCGTGATAATGATCGCCGTGTGCTGAAGCGCATGAATGAAAGGTTCCGTGCCTCTAATACGCATCGACTTGTCTTTCGGGACTCGTCTTTCTTTGACATATTGA |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-35.3 kcal/mol |
| Model |
176063 |
| Alignment |
Sbjct: AGTAAATTC-TCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAAAGGGTGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGATCT-GGACTTCTCG----TCTAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGAATGGGCCTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCTGAAGTGCATGAATGAATGGTCCCGTGCCTCTAAT--GTGTCGA--TGCCTTCTGG----CGTCTTCCTTATTGAC-TTTTGA
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CBCs: ____________________________________________________________________________________________________________________________________________(__________________________________________)_____________________________________________________________________________
HCBCs: __________________(________________)______________________________((__(_______________)_))___________________________________(_____________________________(_________________)_________________________)__________________________(______)___________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 100
II: 100
III: 88.235
IV: 81.818
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 540
End: 798
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