| GI |
5764525  |
| Accession |
AH008106 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma sp. BAFC2557
|
| Sequence |
AATCTTCAACTTACAAGCTCTTTGCGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCTTTAACGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTTCCTTGCGGATCGGCTGTCGGTGTGATAATGTCTACTCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAGCTTTA |
| Structure |
((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...((((((((...).))))))).)))))..........((((((...((..(((...((((.((.(((.(((((...))).)).))))).))).)..)))...)))))))).......(((((.(...))))))....... |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-46.4 kcal/mol |
| Model |
55820070 |
| Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGG-TTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA
....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((.-.(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......)))))..................
Query: ----AATCTTCAACTTACAAGCTCTTTGCGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGG--CCTTTAACGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTTCCTTGCGGATCGGC-TGTCGGTGTGATAATGTCTACTCCGCGACCGTGAAGCG---TTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAGCTTTA-----------
----((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((--((......))))))).)))))..........((((((...((..(((....(((.-((.(((.(((((...))).)).))))).)))....)))---...)))))))).......(((((......))))).......-----------
CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: _____________((_____(__((____))__)_____))___________________________________________________________(___________________________________________________________________)_____________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 100
II: 92.308
III: 88.889
IV: 100
|
| Annotation |
Process: Genbank annotation
Start: 215
End: 407
|
