GI |
5764486  |
Accession |
AF169984 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma lobatum
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Sequence |
AATCTTCAACTTACAAGCTCTTTGCGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCTTTAACGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTCGATTTCCTTGCGGATCGGCTGTCGGTGTGATAATGTCTACTCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAGCTTTA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-42.3 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGG-TTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((.-.(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......))))).................. Query: ----AATCTTCAACTTACAAGCTCTTTGCGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGG--CCTTTAACGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTCGATTTCCTTGCGGATCGGC-TGTCGGTGTGATAATGTCTACTCCGCGACCGTGAAGCG---TTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAGCTTTA----------- ----((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((--((......))))))).)))))..........((((.(...((..(((....(((.-((.(((.(((((...))).)).))))).)))....)))---...))).)))).......(((((......))))).......----------- CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________((_____(__((____))__)_____))_____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 92.308 III: 85.185 IV: 100 |
Annotation |
Process: Genbank annotation
Start: 9
End: 201 |