GI |
5764490  |
Accession |
AF169988 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma lobatum
|
Sequence |
AATCTTCAACTTACAAGCTCTTTGCGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGARGCTTGTCGGCCTTTAACGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTTCCTTGCGGATCGGCTGTCGGTGTGATAATGTCTACTCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAGCTTTA |
Structure |
((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((.(...((((((((...).))))))).).)))..........((((((...((..(((...((((.((.(((.(((((...))).)).))))).))).)..)))...)))))))).......(((((.(...))))))....... |
Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-39.9 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGG-TTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((.-.(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......))))).................. Query: ----AATCTTCAACTTACAAGCTCTTTGCGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGARGCTTGTCGG--CCTTTAACGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTTCCTTGCGGATCGGC-TGTCGGTGTGATAATGTCTACTCCGCGACCGTGAAGCG---TTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAGCTTTA----------- ----((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((.(...(((((--((......))))))).).)))..........((((((...((..(((....(((.-((.(((.(((((...))).)).))))).)))....)))---...)))))))).......(((((......))))).......----------- CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________((_____(__((____))__)_____))___________________________________________________________(___________________________________________________________________)_____________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 84.615 III: 88.889 IV: 100 |
Annotation |
Process: Genbank annotation
Start: 7
End: 199 |