GI |
5764494  |
Accession |
AF169992 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma lobatum
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Sequence |
AATCTTCAACCTACAAGCTCTTTTTGTGGCTCGTAGGCTTGGATTTGGAGGCTTGTTGGCCTTTATTGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTAGTTCCTTGCGGATCGGCTGTCGGTGTGATAATGTCTACTCCGCGACCGTGAAGTGTCTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCTGTTACAGAGACAGCTTTA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-35.7 kcal/mol |
Model |
317416368 |
Alignment |
Sbjct: AATCTTCAACCTACAAGCTTTTTAATGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTATTGGTCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGAGAAGCGTTTTTGGGCGAGCTTCTAGTCGTCTCTG-TATAGAGACAATCTTA ....((((((((((((((((......))))))))))).)))))...(((((((....))))))).((((..((((((((..((((((.....((((((....(((((...((((((((.....))))).)))....)))))))))))..))))))..))).))))).))))..((((((.-...))))))....... Query: AATCTTCAACCTACAAGCTCTTTTTGTGGCTCGTAGGCTTGGATTTGGAGGCTTGTTGGCCTTTATTGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTAGTTCCTTGCGGATCGGC-TGTCGGTGTGATAATGTCTACTCCGCGACCGTGAAGTGTCT---GGCAAGCTTCTAACCGTCTCTGTTACAGAGACAGCTTTA ....((((((((((.((((........)))).))))).)))))...(((((((....))))))).((((..((((.((...(.((((.....(.(.((....(((((...(((-((((.....))))..)))....))))))).).)..)))).)---))..)))).))))..((((((.....))))))....... CBCs: _____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ________________(____________)____________________(________)_____(___________________(________________________________________________________________)___________________)__________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 87.5 II: 100 III: 83.784 IV: 100 |
Annotation |
Process: Genbank annotation
Start: 7
End: 199 |