GI |
5764532  |
Accession |
AH008113 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma lucidum
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Sequence |
AATCTTCAACCTACGAGCTTTTGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGCTGGCCGTTCTTGGTCGGCTCCTCTTAAATGTATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTNTACGCCGCGACCGTGAAGCGCTTTGGGCAAGCTTCTAACCGTGTCACTTGGAGATTGCTTTA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-50.6 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......))))).................. Query: ----AATCTTCAACCTACGAGCTTT---TGTGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGCTGG--CCGTTCTTGGTCGGCTCCTCTTAAATGTATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTC-TCGGTGTGATAATGTNTACGCCGCGACCGTGAAGCGC-TTTGGGCAAGCTTCTAACCGTGTCACT-TGGAGATTGCTTTA----------- ----((..(((((((((((((((.(---.).)))))))))).))))).))(((((...(((((--(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.((-.((((((.((...))..)))))).)))))....))).-...))))))))).......((.((...-..)).)).......----------- CBCs: ___________________________________________________________________(____)____________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________(____(_(___(____)___)_)____)__________________((________________))_____________________(___________________(_________________________)____________________)___________(______________)__________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 94.737 II: 100 III: 92.593 IV: 80 |
Annotation |
Process: Genbank annotation
Start: 211
End: 400 |