GI |
6065745  |
Accession |
AJ249266 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Polyporaceae ; Fibroporia ; Fibroporia vaillantii
|
Sequence |
ATGGAATTATCAAACCTTTCTTTAAATTTATTTTAAAGGTTGGCTTGGACTTGGAGGTTGCTGGCCGCGCCATTTTGTAGTCAGTCAGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGAGTCTTTAATGAGTCGGCTTATCGGTGTGATAAACTTATGCCGTTAGTCAACTTGTAAACAAATCGAGCTTCTAATCGTCTTTGGACAAACATTATAATATGACCTCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-19.3 kcal/mol |
Model |
89031365 |
Alignment |
Sbjct: ATTAAATTCTCAACCTCACCAGTTTTTTTATGAAACTGTGTAAGGCTTGGATGTGGGAGTTTGTGCAGGCTGCGTCAGCGCG------GTCTGCTCTCCTAAAATGCATTAGC--GAGTTTAAACTGAGCTCCGTCTATTGGTGTGATAATTATCTACGCCGTGGATTGGGCT-TAGACT-----TGCTTCTAACCGTCTGCAAGGACAATCTTTTGACAATTTGA------- .........(((((((.(((((((((.....))))))).)).))).))))...((((((.....((((((((((....))))------)))))).)))))).........(((--((((.....((((((((.((((((.((((((((....))).))))))))))).)))))-))))))-----)))).......((((....))))..................------- Query: ATGGAATTATCAAACCTTTCTTTAAATTTATTTTAAAGGTT--GGCTTGGACTTGGAGGT---TGCTGGCCGCGCCATTTTGTAGTCAGTCAGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGAGTCTTTAATGAG-TCGGCTTATCGGTGTGATAA--ACTTATGCCGTTAGTCAACTTGTAAACAAATCGAGCTTCTAATCGTCT--TTGGACAAACATT--ATAATATGACCTCTGA .........((((.(....(((((((.....)))))))...--)..))))....(((((.---.((((((((.(....).))......)))))).)))))..........(((....((......((((-(..(((.((.((((((.(..--).).))))))).)))..).)).)).)).......))).......((((--..)))).......--................ CBCs: ____________________((_(((_____)))_))___________________((________(________________________)____))____________________________________((____________________________))___________________________________________________________________ HCBCs: ______________________________________________________________________((_(____)_))______________________________________________(_(____________(_(________)__)___________)_)_____________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 75 II: 87.5 III: 75.862 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 380
End: 600 |