| GI |
61657558  |
| Accession |
AJ889938 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; Clavulina ; Clavulina cristata
|
| Sequence |
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGYTTCACAGATTGTACAATCTGTGTTCCACATTTCAGC |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-9.8 kcal/mol |
| Model |
21667025 |
| Alignment |
Sbjct: -ATGAAATTCTCAACCC---ATAAATCCTT--GTGATCTATGGGCTTGGATTTGGAGGCTTGCTG-GCCCT--AGTGGT-CGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTTGATTCCGTGCGG-ATCGGCT---CTCAGTGTGATAATTGTCTA--CGCTGTGACCGTGAAGCGTTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCCATTAGGACAATCTTATAACATCTGA----------------------------
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Query: GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGT-TGCTTCTAAACTTGGYTTCACAGATTGTACAATCTGTGTTCCACATTTCAGC
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CBCs: ______________(_(_____(_______________)__)_)___________(_(___________________________)_)________________(_______________(_______________________________________)______________)____________((______))______________________________________________
HCBCs: _________________________(_________)___________________________(___(_________)___)___________________________(___(__________(________(_(___________)___)_____)________)______)_____________(__________)_____________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 84.615
II: 78.571
III: 88
IV: 75
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| Annotation |
Process: Mixed HMM and Genbank annotation
Start: 296
End: 538
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