GI |
62275822  |
Accession |
AY884175 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma carnosum
|
Sequence |
ATGAAATCTTCAACCTAGAAGCCTTTGCGGGTTTGTAGGCTTGGATTTGGAGGCTTGTCGGCCCTTTGTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGYGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTCGCTTGAAGACAGCTTTATGACCTCTGA |
Structure |
........(((((((((.((((((....)))))).)))).)))))...(((((...((((((((...)..))))))).)))))...........(((.(.(..(((.....((((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)))).))..))).(((((((((.((....)).)))..)).))))............. |
Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-37.6 kcal/mol |
Model |
5764500 |
Alignment |
Sbjct: ----AATCTTCAACTTACAGACCTTTGCGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTGTTTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTT-CGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGYGTTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCTCGTTTG--GACAGCTTTA---------- ----....((((((((((((((((....))))))))))).)))))...(((((...((((((((.....)))))))).)))))...........(((.(((..(((-(....(((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)))).)))..))).(((((((((.((....)).)))--)).))))...---------- Query: ATGAAATCTTCAACCTAGAAGCCTTTGCGGGTTTGTAGGCTTGGATTTGGAGGCTTGTCGGCCCTTTGTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGYGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCG-TTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTCGCTTGAAGACAGCTTTATGACCTCTGA ........(((((((((.((((((....)))))).)))).)))))...(((((...(((((((.......))))))).)))))...........(((.(.(..(((......(((.((.(((((((((...))).)))))).)))))..))).)-)..))).(((((((((.((....)).)))..)).))))............. CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________(____((__________))____)________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 93.75 II: 92.308 III: 91.667 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 413
End: 617 |