GI |
633200  |
Accession |
X74927 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Russulales ; Bondarzewiaceae ; Heterobasidion ; Heterobasidion annosum species complex ; Heterobasidion annosum
|
Sequence |
GTGAAATTCTCAACCCCGTGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGTTTTGCTGGTCCTCGCGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCGTCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGGGTACGCCGCGATTGTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAACTTTATCGAAACTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-43.4 kcal/mol |
Model |
76786575 |
Alignment |
Sbjct: GTGAAATTCTCAACCCCGT--CTTCTTTYTTGAAGAGCGGAGG-TTGGACTTGGAGGTCGTTGCCGGTCCTTTTGTGATCGGCTCCTCTGGAATGCATTAGCGAGACCCTTGCGGTGGCG-CCTTGGTGTGATAATTGTCTACGCCAT-GGACGTGCCGCGATTTCATGGGGCGCTCGCTTCGAACCGTCGCAAGACACTTTCATCGAACC---- .........((((((((((--((((......))))).))).))-))))..(((((((.....(((((((.......))))))).)))))))........((((((.(((((((((((.((-((.(((((((((....))).)))))).-)).))))))))))......)))...))))))((((...(((....))).......))))...---- Query: GTGAAATTCTCAACCCCGTGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGTT-TTGCTGGTCCTCGCG-GATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCGTCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGGGTACGCCGCGATT--GTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAACTTTATCGAAACTTGA .........((((((.((...((((......))))..))..)).))))..(.(((((..-..(((((((......-))))))).))))).)........((((.(.(((((((((((..(.((.(((((((((....))).))))))..)).).))))))))..--..)))...).))))((.(...(((....))).......).))....... CBCs: ________________________(______)____________________________________________________________________________________________(_____________________)____________________________________________________________________ HCBCs: _____________________(____________)_______________(_____________(_______________)_________)___________(_________(___(__(________________________________)_)___)_________________)______________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 85.714 II: 92.857 III: 93.333 IV: 85.714 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 365
End: 575 |