GI |
6650275  |
Accession |
AF081292 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Ascomycota ; saccharomyceta ; Pezizomycotina ; leotiomyceta ; sordariomyceta ; Sordariomycetes ; Hypocreomycetidae ; Hypocreomycetidae incertae sedis ; Glomerellaceae ; Glomerella ; Glomerella acutata
|
Sequence |
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATTCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAAATTTTTTACAGG |
Structure |
....(((...((((((...))))))..)))(((((.((((.....)))))))))...........((((((((((((.(((...((((.((((.(((.....)).)..))))..)))))))))))))..))).)))((((((.....(...)))))))... |
Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-41.2 kcal/mol |
Model |
226235066 |
Alignment |
Sbjct: ATTTCAACCCTCAAGCCCGGCTTGGTGTTGGGGCCCTACGGTCGACGTAGGCCCTTAAAGATAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCATCGGGATCCGGAGGGACTCCTGCCGTAAAACCCCC-ATCTTTTTACTGG ....((((..((((((...)))))).))))(((((.((((.....)))))))))...........((((((((((((.(((...((((.((((..((.....))....))))..)))))))))))))..))).)))((((((.....-....))))))... Query: ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATTCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAAATTTTTTACAGG ....(((...((((((...))))))..)))(((((.((((.....)))))))))...........((((((((((((.(((...((((.((((..((.....))....))))..)))))))))))))..))).)))((((((..........))))))... CBCs: ____________________________________(___________)________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ____________________________________________________________________(__________(_______________________________________)___________)_____________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 90 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: Mixed HMM and Genbank annotation
Start: 335
End: 495 |