GI |
6650329  |
Accession |
AF090853 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Ascomycota ; saccharomyceta ; Pezizomycotina ; leotiomyceta ; sordariomyceta ; Sordariomycetes ; Hypocreomycetidae ; Hypocreomycetidae incertae sedis ; Glomerellaceae ; Glomerella ; Glomerella acutata
|
Sequence |
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATTCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAAATTTTTTACTAGGTTGA |
Structure |
....(((...((((((...))))))..)))((((.(((((.....))))))))).....(((.(((((((((((((.((((...((((.((((.((..((....))))))))..)))))))))))))..))).)))))...)))..(((..(((.....)))))). |
Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-48 kcal/mol |
Model |
155676215 |
Alignment |
Sbjct: ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCTCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGACTCTAGCCGTAAAACCCCCAA--TTTTACCAAGGTTGA ....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).))))....)))..(((--((((...))))))). Query: ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAAC-TAACGTCTCGCACTGGGATTCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAAATTTTTTACTAGGTTGA ....(((...((((((...))))))..)))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((((((((.((((...((((.((((.((..((-....))))))))..)))))))))))))..))).))))....)))..(((..(((.....)))))). CBCs: ____________________________________(___________)______________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 90 II: 100 III: 100 IV: 85.714 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 365
End: 530 |