Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
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ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)


Chlorophyta hypertree

(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

GI 682762

Figure

(Save as SVG or PNG) view with Pseudoviewer

Details

GI 682762 see NCBI Nucleotide
Accession X75817
Date 2011/04/01
Lineage see NCBI Taxonomy root cellular organisms Eukaryota Fungi/Metazoa group Metazoa Eumetazoa Bilateria Coelomata Protostomia Panarthropoda Arthropoda Mandibulata Pancrustacea Hexapoda Insecta Dicondylia Pterygota Neoptera Endopterygota Diptera Nematocera Culicimorpha Culicoidea Culicidae Culicinae Culicini Culex Culex Culex pipiens complex Culex pipiens 
Sequence TATATTTATCTATTCAACTGTGCACGCAGTGCACGCAGAATGGTGTTTTGCTGCCTTCGGTGGCTGGCAAAACATTCAAGACGCTCAGCGGCTCGGGGTTTTCGTTCGGCGGACGGCCACACTGGTGCGCACGCAGCGACTGAACGGACGACGACGACGGTGAGAATACATCCCACACACCAACCTGGCTTGGGCGGCCGATGTAGCATCTCTCACGCCACGTCGTCGTCACACGTTCGTTCGGTCATCCGGCGTCGTCGCGGTACCGCGTCCACAGAACAGAACAACCCAACACACGAGCAGCGAACGACAAGCGATAAGATAAACCCCCATGTA
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Method 2: Homology modeled
Energy -106.31 kcal/mol
Model 323715560
Alignment
Sbjct: ---ATTTATCTATTCAACTGTGCACGCAGTGCACGCAGAATGGTGTTTTGCTGCCTTCGGTGGCTGGCAAAACATTCAAGACGCTCAGCGGCTCGGGGTTTTCGTTCGGCGGACGGCCACACTGGTGCGCACGCACGCGACTGAACGGACGACGACGACGGTGAGAATACATCCCACACACCAACCTGGCTTGGGC-GCCGATGTAGCATCTCTCACGCCACGTCGTCGTCACACGTTCGTTCGGTCATCCGGCGTCGTCGCGGTACCGCGTCCACAGAACAGAACAACCCAACACACGAGCAGCGATCGAT-AGCGATAAGATAAACCCCCCCA--
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Query: TATATTTATCTATTCAACTGTGCACGCAGTGCACGCAGAATGGTGTTTTGCTGCCTTCGGTGGCTGGCAAAACATTCAAGACGCTCAGCGGCTCGGGGTTTTCGTTCGGCGGACGGCCACACTGGTGCGCACGCA-GCGACTGAACGGACGACGACGACGGTGAGAATACATCCCACACACCAACCTGGCTTGGGCGGCCGATGTAGCATCTCTCACGCCACGTCGTCGTCACACGTTCGTTCGGTCATCCGGCGTCGTCGCGGTACCGCGTCCACAGAACAGAACAACCCAACACACGAGCAGCGAACGACAAGCGATAAGATAAACCCCCATGTA
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 CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
Transferred percentage of helices I: 100
II: 100
III: 98.701
IV: 75
Annotation Process: HMM annotation
Start: 137
End: 472

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