| GI |
1754550  |
| Accession |
AB000012 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Ceratobasidiaceae ; Thanatephorus ; Thanatephorus cucumeris ; Rhizoctonia solani
|
| Sequence |
ATGAAATCTTCAAAGTCAAACCTTTTGTTAACTCAATTGGTTCTGCTTTGGTATTGGAGGTCTATTGCAGCTTCACACCTGCTCCTCTTTGTGCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACACCCTGTTAAAAAGGGGTGGCCAAGGTAAATGCAGATGAACTGCTTCTAACAGTCCATTGACTTGGACAAATATTAATTTTATGATCTGA |
| Structure |
.........(((((((.(((((..(((......)))..)))).))))))))....(((((...(..((((..(...).))))))))))..((.((((.((...((.((.((.(.(((...((((...((((((((((((...)))).).)))))))))).)..))).).)......)......)).)..))).)))).))...........(((((......)))))...................... |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-14.1 kcal/mol |
| Model |
117938168 |
| Alignment |
Sbjct: ATGAAATCTTCAAAGT-AAATCTTTTGTTAACTCAATTGGTNCTACTTTGGTATTGGAGGTCT-TTGCAGCTTCACACCTGCTCCTCTTCGTTCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACA--CTGTAACAC----GTGGCCAAGGGAAATGCAGATGAACCGCTTCTAATAGTCCATTGACTTGGAC----ACTATTTTTATGATCTGA
.........(((((((-(.(((..(((......)))..)))..))))))))....(((((...-..((((........)))).)))))..(((((((.((....((((.((((((((....(((...(((((((.((((...))))...)))))))))).--.))))))))----........))))...)).)))))))...........(((((......)))))----..................
Query: ATGAAATCTTCAAAGTCAAACCTTTTGTTAACTCAATTGGTTCTGCTTTGGTATTGGAGGTCTATTGCAGCTTCACACCTGCTCCTCTTTGTGCATTAGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGGTTCCACTCAGCGTGATAAGTTATCTATCGCTGAGGACACCCTGTTAAAAAGGGGTGGCCAAGGTAAATGCAGATGAACTGCTTCTAACAGTCCATTGACTTGGACAAATATTAATTTTATGATCTGA
.........(((((((.(.(((..(((......)))..)))..))))))))....(((((......((((........)))).)))))..((.((((.((....(.((..(.(.(((....(((...(((((((.((((...))))...))))))))))....))).).).............)).)...)).)))).))...........(((((......)))))......................
CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: _______________(____(__________________)____)____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 100
II: 100
III: 85.714
IV: 100
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 377
End: 625
|
