GI |
722285  |
Accession |
U22112 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Bilateria ; Coelomata ; Protostomia ; Panarthropoda ; Arthropoda ; Mandibulata ; Pancrustacea ; Hexapoda ; Insecta ; Dicondylia ; Pterygota ; Neoptera ; Endopterygota ; Diptera ; Nematocera ; Culicimorpha ; Culicoidea ; Culicidae ; Culicinae ; Culicini ; Culex ; Culex ; Culex pipiens complex ; Culex pipiens
|
Sequence |
TATATTTATCTATTCAACTGTGCACGCAGTGCACGCAGAATGGTGTTTTGCTGCCTTCGGTGGCTGGCAAAACATTCAAGACGCTCAGCGGCTCGGGGTTTTCGTTCGCGGACGGCCACACTGGTGCGCACGCACGCGACTGAACGGACGACGACGGTGAGAATACATCCCACACACCAACCTGGCTTGGGCGCCGATGTAGCATCTCTCACGCCACGTCGTCGTCACACGTTCGTTCGGTCATCCGGCGTCTCGCGCGGTACCGCGTCCACAGAACAGAACAACCCAACACACGAGCAGCGAACGACAAGCGATAAGATAAACCCCCATGTA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-101.02 kcal/mol |
Model |
312270540 |
Alignment |
Sbjct: ---ATTTATCTATTCAACTGTGCACGCAGTGCACGCAGAATGGTGTTTTGCTGCCTTCGGTGGCTGGCAAAACATTCAAGACGCTCAGCGGCTCGGGGTTTTCGTTCGGCGGACGGCCACACTGGTGCGCACGCACGCGACTGAACGGACGACGACGGTGAGAATACATCCCACACACCAACCTGGCTTGGGCGCCGATGTAGCATCTCTCACGCCACGTCGTCGTCACACGTTCGTTCGGTCATCCGGCGTCGT-CGCGGTACCGCGTCCACAGAACAGAACAACCCAACACACGAGCATGCGATCGAT-AGCGATAAGATAAACCCCCCCCA- ---......((((((...(((((((...)))))))..))))))((((((((((((......))).))))))))).............((((((((((((((((((((...(((((.......(((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((.((((((.......((((......)))).....)))))).....))))))....)))))))))).......))))))))).....)))))))-.)).)))))))))))...)))).))).)))))......))))).))).((((..-..)))).................- Query: TATATTTATCTATTCAACTGTGCACGCAGTGCACGCAGAATGGTGTTTTGCTGCCTTCGGTGGCTGGCAAAACATTCAAGACGCTCAGCGGCTCGGGGTTTTCGTTC-GCGGACGGCCACACTGGTGCGCACGCACGCGACTGAACGGACGACGACGGTGAGAATACATCCCACACACCAACCTGGCTTGGGCGCCGATGTAGCATCTCTCACGCCACGTCGTCGTCACACGTTCGTTCGGTCATCCGGCGTCTCGCGCGGTACCGCGTCCACAGAACAGAACAACCCAACACACGAGCA-GCGAACGACAAGCGATAAGATAAACCCCCATGTA .........((((((...(((((((...)))))))..))))))((((((((((((......))).))))))))).............((.(((((((((((((((((-..(((((.......((((((((..(.(((((((((((((((((((((((((((((.((((((.......((((......)))).....)))))).....))))))....)))))))))).......))))))))).....)))))....)).)))))))))))...)))).))).)))))......))))).-)).(.((.....)).).................. CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 96 IV: 75 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 879
End: 1211 |