GI |
722289  |
Accession |
U22116 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Bilateria ; Coelomata ; Protostomia ; Panarthropoda ; Arthropoda ; Mandibulata ; Pancrustacea ; Hexapoda ; Insecta ; Dicondylia ; Pterygota ; Neoptera ; Endopterygota ; Diptera ; Nematocera ; Culicimorpha ; Culicoidea ; Culicidae ; Culicinae ; Culicini ; Culex ; Culex ; Culex pipiens complex ; Culex pipiens
|
Sequence |
TATATTTATCTATTCAACTGTGCACGCAGTGCACGCAGAATGGTGTTTTGCTGCCTTCGGTGGCTGGCAAAACATTCAAGACGCTCAGCGGCTCGGGGTTTTCGTTCGGCGGACGGCCACACTGGTGCGCACGCACGCGACTGAACGGACGACGACGGTGAGAATACATCCCACACACCAACCTGGCTTGGGCGCCGATGTAGCATCTCTCACGCACACGTCGTCGTCACACGTTCGTTCGGTCATCCGGCGTCGTCGCGGTACCGCGTCCACAGAACAGAACAACCCAACACACGAGCAGCGAACGACAAGCGATAAGATAAACCCCCATGTA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-106.92 kcal/mol |
Model |
312270540 |
Alignment |
Sbjct: ---ATTTATCTATTCAACTGTGCACGCAGTGCACGCAGAATGGTGTTTTGCTGCCTTCGGTGGCTGGCAAAACATTCAAGACGCTCAGCGGCTCGGGGTTTTCGTTCGGCGGACGGCCACACTGGTGCGCACGCACGCGACTGAACGGACGACGACGGTGAGAATACATCCCACACACCAACCTGGCTTGGGCGCCGATGTAGCATCTCTCACGC-CACGTCGTCGTCACACGTTCGTTCGGTCATCCGGCGTCGTCGCGGTACCGCGTCCACAGAACAGAACAACCCAACACACGAGCATGCGATCGAT-AGCGATAAGATAAACCCCCCCCA- ---......((((((...(((((((...)))))))..))))))((((((((((((......))).))))))))).............((((((((((((((((((((...(((((.......(((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((.((((((.......((((......)))).....)))))).....))))))..-..)))))))))).......))))))))).....))))))).)).)))))))))))...)))).))).)))))......))))).))).((((..-..)))).................- Query: TATATTTATCTATTCAACTGTGCACGCAGTGCACGCAGAATGGTGTTTTGCTGCCTTCGGTGGCTGGCAAAACATTCAAGACGCTCAGCGGCTCGGGGTTTTCGTTCGGCGGACGGCCACACTGGTGCGCACGCACGCGACTGAACGGACGACGACGGTGAGAATACATCCCACACACCAACCTGGCTTGGGCGCCGATGTAGCATCTCTCACGCACACGTCGTCGTCACACGTTCGTTCGGTCATCCGGCGTCGTCGCGGTACCGCGTCCACAGAACAGAACAACCCAACACACGAGCA-GCGAACGACAAGCGATAAGATAAACCCCCATGTA .........((((((...(((((((...)))))))..))))))((((((((((((......))).))))))))).............((.(((((((((((((((((...(((((.......(((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((.((((((.......((((......)))).....)))))).....)))))).....)))))))))).......))))))))).....))))))).)).)))))))))))...)))).))).)))))......))))).-)).(.((.....)).).................. CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 98.667 IV: 75 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 881
End: 1214 |