GI |
722290  |
Accession |
U22117 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Bilateria ; Coelomata ; Protostomia ; Panarthropoda ; Arthropoda ; Mandibulata ; Pancrustacea ; Hexapoda ; Insecta ; Dicondylia ; Pterygota ; Neoptera ; Endopterygota ; Diptera ; Nematocera ; Culicimorpha ; Culicoidea ; Culicidae ; Culicinae ; Culicini ; Culex ; Culex ; Culex pipiens complex ; Culex pipiens
|
Sequence |
TATATTTATCTATTCAACTGTGCACGCAGTGCACGCAGAATGGTGTTTTGCTGCCTTCGGTGGCTGGCAAAACATTCAAGACGCTCAGCGGCTCGGGGTTTTCGTTCGGCGGACGGCCACACTGGTGCGCACGCACGCGACTGAACGGACGACGACGACGGTGAGAATACATCCCACACACCAACCTGGCTTGGGCGCCGATGTAGCATCTCTCACGCACGTCGTCACACGTTCGTTCGGTCATCCGGCGTCGTCGCGGTACCGCGTCCACAGAACAGAACAACCCAACACACGAGCAGCGAACGACAAGCGATAAGATAAACCCCCCCATGTA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-110.41 kcal/mol |
Model |
323715561 |
Alignment |
Sbjct: ---ATTTATCTATTCAACTGTGCACGCAGTGCACGCAGAATGGTGTTTTGCTGCCTTCGGTGGCTGGCAAAACATTCAAGACGCTCAGCGGCTCGGGGTTTTCGTTCGGCGGACGGCCACACTGGTGCGCACGCACGCGACTGAACGGACGACGACGACGGTGAGAATACATCCCACACACCAACCTGGCTTGGGCGCCGATGTAGCATCTCTCACGCACGTCGTCACACGTTCGTTCGGTCATCCGGCGTCGTCGCGGTACCGCGTCCACAGAACAGAACAACCCAACACACGAGCATGCGATCGAT-AGCGATAAGATAAACCCCCCCA---- ---......((((((...(((((((...)))))))..))))))((((((((((((......))).))))))))).............((((((((((((((((((((...(((((.......(((((((((((.(((((((((((((((((..(((((((((((((.((((((.......((((......)))).....)))))).....))))))...)))))))...))))))))))))).....))))))).)).)))))))))))...)))).))).)))))......))))).))).((((..-..))))................---- Query: TATATTTATCTATTCAACTGTGCACGCAGTGCACGCAGAATGGTGTTTTGCTGCCTTCGGTGGCTGGCAAAACATTCAAGACGCTCAGCGGCTCGGGGTTTTCGTTCGGCGGACGGCCACACTGGTGCGCACGCACGCGACTGAACGGACGACGACGACGGTGAGAATACATCCCACACACCAACCTGGCTTGGGCGCCGATGTAGCATCTCTCACGCACGTCGTCACACGTTCGTTCGGTCATCCGGCGTCGTCGCGGTACCGCGTCCACAGAACAGAACAACCCAACACACGAGCA-GCGAACGACAAGCGATAAGATAAACCCCCCCATGTA .........((((((...(((((((...)))))))..))))))((((((((((((......))).))))))))).............((.(((((((((((((((((...(((((.......(((((((((((.(((((((((((((((((..(((((((((((((.((((((.......((((......)))).....)))))).....))))))...)))))))...))))))))))))).....))))))).)).)))))))))))...)))).))).)))))......))))).-)).(.((.....)).).................... CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 98.684 IV: 75 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 880
End: 1213 |