GI |
722294  |
Accession |
U22121 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Bilateria ; Coelomata ; Protostomia ; Panarthropoda ; Arthropoda ; Mandibulata ; Pancrustacea ; Hexapoda ; Insecta ; Dicondylia ; Pterygota ; Neoptera ; Endopterygota ; Diptera ; Nematocera ; Culicimorpha ; Culicoidea ; Culicidae ; Culicinae ; Culicini ; Culex ; Culex ; Culex pipiens complex ; Culex pipiens
|
Sequence |
TATATTTATCTATTCAACTGTGCGCACACACGCACGCAGAATGGTGTTTTGCTGCCTTCGGTGGCTGGCAAAACATTCAAGACGCTCAGCGGCTCGGGGTTTTCGTTCGCGGACGGCCACACTGGTGCGCACGCACGCGACTGAACGGACGACGACGACGGTGAGAATACATCCCACACACCAACCTGGCTTGGGCGCCGATGTAGCATCTCTCACGCCACGTCGTCGTCACACGTTCGTTCGGTCATCCGGCGTCGTCGCGGTACCGCGTCCACAGAACAGAACAACCCAACACACGAGCAGCGATCGACAAGCGATAAGCTAAACCCCCCATGTA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-116.41 kcal/mol |
Model |
312270537 |
Alignment |
Sbjct: ---ATTTATCTATTCAACTGTGCGCACACACGCACGCAGAATGGTGTTTTGCTGCCTTCGGTGGCTGGCAAAACATTCAAGACGCTCAGCGGCTCGGGGTTTTCGTTCGGCGGACGGCCACACTGGTGCGCACGCACGCGACTGAACGGACGACGACGACGGTGAGAATACATCCCACACACCAACCTGGCTTGGGCGCCGATGTAGCATCTCTCACGCCACGTCGTCGTCACACGTTCGTTCGGTCATCCGGCGTCGTCGCGGTACCGCGTCCACAGAACAGAACAACCCAACACACGAGCAGCGATCGACAAGCGATAAGATAAACCCCCCA---- ---......((((((...((((((......))))))..))))))((((((((((((......))).))))))))).............((.(((((((((((((((((...(((((.......(((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((.......((((......)))).....)))))).....))))))....))))))))))....)))))))))))).....))))))).)).)))))))))))...)))).))).)))))......))))).)).((((.....))))...............---- Query: TATATTTATCTATTCAACTGTGCGCACACACGCACGCAGAATGGTGTTTTGCTGCCTTCGGTGGCTGGCAAAACATTCAAGACGCTCAGCGGCTCGGGGTTTTCGTTC-GCGGACGGCCACACTGGTGCGCACGCACGCGACTGAACGGACGACGACGACGGTGAGAATACATCCCACACACCAACCTGGCTTGGGCGCCGATGTAGCATCTCTCACGCCACGTCGTCGTCACACGTTCGTTCGGTCATCCGGCGTCGTCGCGGTACCGCGTCCACAGAACAGAACAACCCAACACACGAGCAGCGATCGACAAGCGATAAGCTAAACCCCCCATGTA .........((((((...((((((......))))))..))))))((((((((((((......))).))))))))).............((.(((((((((((((((((-..(((((.......(((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((.......((((......)))).....)))))).....))))))....))))))))))....)))))))))))).....))))))).)).)))))))))))...)))).))).)))))......))))).)).((((.....))))................... CBCs: __________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: __________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 872
End: 1208 |