| GI |
13897644  |
| Accession |
AF255104 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma sp. PKB96/332
|
| Sequence |
ATGAAATCTTCAACTTACGAGCTTCTTGCGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTATAGAGACAAGTTTATGACCTCT |
| Structure |
....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...((((((((....)))))))).)))))..........((((((..((..(((...((((.(((.(((((((((...))).)))))))))))).)..)))...)))))))).......((((((...).)))))............... |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-49.3 kcal/mol |
| Model |
55820070 |
| Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA
....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......)))))..................
Query: ATGAAATCTTCAACTTACGAGCTTCTTGCGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGT--CTTTAAAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGGTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCG---TTTGGCAAGCTTCTAACCGTCTCGGTATAGAGACAA-GTTTATGACCTCT--
....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((.--((....)).))))).)))))..........((((((..((..(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....)))---...)))))))).......(((((......)))))..-.............--
CBCs: _____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: _____________((___(_(____________)_)___))___________________________________________________________(__________________________________________________________________)_____________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 100
II: 92.308
III: 96.296
IV: 100
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 360
End: 564
|
