GI |
13897677  |
Accession |
AF255137 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma sp. JMCR.142
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Sequence |
ATGAAATCTTCAATCCATAAGCTTCTTAATTGGAGTTTGTAGTCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTATAGAGACAACTTTATGACCTCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-43.9 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTA--TGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((((...--.)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......))))).................. Query: ATGAAATCTTCAATCCATAAGCTTCTTAATTGGAGTTTGTAGTCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGT-CCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTATAGAGACAAC-TTTATGACCTCTGA ....((..(((((.(.(((((((((......))))))))).)..))))).))(((((...(((((.-(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......)))))...-.............. CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _________________(__(_(__________)_)__)________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 89.474 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Model for |
root

| cellular organisms

Eukaryota

Fungi/Metazoa group

Fungi

Dikarya

Basidiomycota

Agaricomycotina

Agaricomycetes

Agaricomycetidae

Agaricales

Hygrophoraceae

Hygrophorus

Hygrophorus cossus

| Hygrophorus quercetorum

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Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 371
End: 583 |