GI |
13897729  |
Accession |
AF255189 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma sp. LXT.6
|
Sequence |
ATGAAATCTTCAACTTGCAAGCTCTTTGCGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCTTTAATGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTNCCTTGCGGATCGGCTGTCGGTGTGATAATGTCTACTCCGCGACCGTGAAGCGTCTGGCAAGCTTCTAACAGTCTCGTTACNGAGACAGCTTTATGACCTCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-41.1 kcal/mol |
Model |
55820070 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATCTACAAACTTCTTATGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTT-CCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTACAGAGACAACTTTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(-((.(((....(((.(((.(((((((((...))).))))))))))))....))).....))))))))).......(((((......))))).................. Query: ATGAAATCTTCAACTTGCAAGCTCTTTGCGGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGG--CCTTTAATGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTNCCTTGCGGATCGGC-TGTCGGTGTGATAATGTCTACTCCGCGACCGTGAAGCGTCT---GGCAAGCTTCTAACAGTCTCGTTACNGAGACAGC-TTTATGACCTCTGA ....((..(((((((((((((((((....)))))))))))).))))).))(((((...(((((--((......))))))).)))))..........((((((..(.(..(((....(((.-((.(((.(((((...))).)).))))).)))....)))...---)))))))).......(((((......)))))...-.............. CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _____________((_(___(__((____))__)___)_))___________________________________________________________(___________________________________________________________________)_____________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 92.308 III: 88.889 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 372
End: 578 |