| GI |
76786688  |
| Accession |
DQ202266 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Clavulinaceae ; Clavulina ; Clavulina sp. MB03-034
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| Sequence |
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTTTGTCTATCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCTTTATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGACCCTTGTGTAGCACCGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGAGGTGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACATGGTTTCGCAGATTGTTCAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCT |
| Structure |
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| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-4.8 kcal/mol |
| Model |
115430555 |
| Alignment |
Sbjct: -ATGGAATTCTCAA-CTTATAAATCCTTGTG---ATCTATAAGCTTGGACTTGGAGGCTTGCTG-GCCCTYGTTGGT-CGGCTCCTCTTGAATGCATTAGCTCGATTCCGTACGG-ATCGGCT---CTCAGTGTGATAATTGTCTA--CGCTGTGACCGTGAAGTGTTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCATTAGGACAACTTTTTAACATCTGA------------------------------------
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Query: GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTTTGTCTATCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCTTTATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGACCCTTGTGTAGCACCGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGAGGTGGCCAGTT--------CTCATTTGGGTTGCTTCTAAACATGGTTTCGCAGATTGTTCAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCT
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CBCs: ___________________(__________________)_______________(_(__________________________)_)________________(______________________________________________________________________)____________(________)______________________________________________________
HCBCs: ________________(_(___(____________)___)_)____________________(___(________)___)___________________(_______((___((________(________(_(___________)___)_____)________))____))____)__________(______)_______________________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 76.923
II: 83.333
III: 84.615
IV: 75
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| Annotation |
Process: Mixed HMM and Genbank annotation
Start: 362
End: 603
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