GI |
77557442  |
Accession |
DQ206985 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Ganodermataceae ; Ganoderma ; Ganoderma tsugae
|
Sequence |
ATGATATCTTCAACCTACAAGCCTTTGCGGGTTTGCAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCCTTTGTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCGTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTCGCTTGAAGACAGCTTTATGACCT |
Structure |
........((((((((.(((((((....))))))).))).)))))...(((((...((((((((...)..))))))).)))))...........(((.(.(..(((.(..(.(((.((.(((((((((...))).)))))).)))))))))).))..))).(((((((((.((....)).)))..)).))))......... |
Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-37.8 kcal/mol |
Model |
5764500 |
Alignment |
Sbjct: ----AATCTTCAACTTACAGACCTTTGCGGGTTTGTAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCGTGTTTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTT-CGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGYGTTTTGGCGAGCTTCTAACCGTCCTCGTTTG--GACAGCTTTA------ ----....((((((((((((((((....))))))))))).)))))...(((((...((((((((.....)))))))).)))))...........(((.(((..(((-(....(((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)))).)))..))).(((((((((.((....)).)))--)).))))...------ Query: ATGATATCTTCAACCTACAAGCCTTTGCGGGTTTGCAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGCCCTTTGTCGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGATTCCTTGCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAATGTCTACGCCGCGACCGTGAAGCG-TTTGGCGAGCTTCTAACCGTCTTCGCTTGAAGACAGCTTTATGACCT ........((((((((.(((((((....))))))).))).)))))...(((((...(((((((.......))))))).)))))...........(((.(.(..(((.(....(((.((.(((((((((...))).)))))).))))).)))).)-)..))).(((((((((.((....)).)))..)).))))......... CBCs: __________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________(____((__________))____)____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 93.75 II: 92.308 III: 95.833 IV: 100 |
Annotation |
Process: Mixed HMM and Genbank annotation
Start: 356
End: 556 |