GI |
8101484  |
Accession |
AF133780 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; environmental samples ; uncultured fungus from Acaulospora colossica spore IVB.12
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Sequence |
ATGAGCACTCTCACAACTAACCTTTGGGTGAAATTGTGGAATTGGAATGCGCCGATTGTAATAATCAGCCCTTCTAAAATATATTTCATGACTGTCACCTAACACAGCAGTTTGGCCTAATAGTTTTGACATTGATTTGTCAAATCTTTGGCTTACATTTGCTTCAGGTTGTCAGTCTTGATAATACAGAAAACTCATTCAAATTTT |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-23.3 kcal/mol |
Model |
194022384 |
Alignment |
Sbjct: ATGAGCACTCTCACACCTAACCTTTGGGTTATGTTGTGGAATTGGGATGCGCCGATTTTTACTAGTCGGCACTCCTAAAATGTAGCTCTTGGCTGTTTCCTATTACAGCAGTTTGGCCTAATAGTTTTGAC----TTTTGTCAAATCTTTGGC-TACATTTGCTTCTGGAAATCAGTCTTGATAATACAGAAAACTCATTTCAAACTTTGA ..........((((((.(((((....))))).).)))))..((((((...(((((((......)))))))..))))))..((((..((..((((((((((......(((((..(((((....((.((((((----....)))))).))..)))-))...)))))...))))).)))))..))...))))((((.....))))......... Query: ATGAGCACTCTCACAACTAACCTTTGGGTGAAATTGTGGAATTGGAATGCGCCGATTGTAA-TAATCAGCCCTTCTAAAATATATTTCATGACTGTCACCTAACACAGCAGTTTGGCCTAATAGTTTTGACATTGATTTGTCAAATCTTTGGCTTACATTTGCTTCAGGTTGTCAGTCTTGATAATACAGAAAACTCA-TTCAAATTTT-- ..........(((((..(.(((....))).)...)))))..((((((...((.((((....-.)))).))..))))))..(.((..((..((((((.(((......(((((..(((((....((.((((((........)))))).))..))).))...)))))...))).).)))))..))...)).)(((......-))).......-- CBCs: _____________________________________________(___________________________)_______________________(_______________________________________________________________________)_________________________________________ HCBCs: _______________________________________________________(________)__________________________(___(___________________________________________________________________________)____)__________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 81.818 II: 92.308 III: 94.118 IV: 75 |
Model for |
root

| cellular organisms

Eukaryota

Fungi/Metazoa group

Fungi

unclassified Fungi

fungal sp. 132c

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| Fungi incertae sedis

Basal fungal lineages

Mucoromycotina

Mucorales

Mucorales incertae sedis

Umbelopsis

Umbelopsis ramanniana

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| Mortierellales

Mortierellaceae

Mortierella

Mortierella sp. olrim338

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Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 352
End: 558 |