| GI |
81345668  |
| Accession |
DQ267123 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Polyporales ; Polyporaceae ; Polyporus ; Polyporus squamosus
|
| Sequence |
ATGAAATTCTCAACCTTACAAACTTTTGTGTTTGATTTGGCTTGGAGTTGGAGGCTTGCTGATGGGAAATTCCTTTGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATTGGCTCCTGGTGTGATAAATGTTTACGCCGCAGCTGTTGAAGCGATTTGGGCAAGCTCCTAACCGTCTCGATATTGAGAGACAGCTTTTTGAACATGACAT |
| Structure |
....((..(((((((..((((((......)))))..).)).)))).)))(((((...(((((..(((...).))))))).)))))..........((((((..(((((((...((((.(..(((((((((....))).))))))..))))..)..))))...))))))))).......(((((..(...).)))))................... |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-19.8 kcal/mol |
| Model |
55820070 |
| Alignment |
Sbjct: ATGAAATMTTCAATC-TACAAACTTCTTATGGGGTTTG--TAGGCTTGGACTTGGAGGCTTGTCGGTCCCTTTACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATCGGCTTGTCGGTGTGAT-AATGTCTACGCCGCGACCG-TGAAGCGTGTTTGGGCGAGCTTCTAACCGTCTCGTTAC--AGAGACAACTTTTATGACCTCTGA-
....((..(((((((-((((((((((....))))))))--)))).))))).))(((((...(((((..(((....)))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(((.(((((((((-...))).))))))))))))-....))).....))))))))).......(((((.....--.)))))..................-
Query: ATGAAATTCTCAACCTTACAAACTTTT----GTGTTTGATTTGGCTTGGAGTTGGAGGCTTGCTGATGGGAAATTCCTTTGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCTTGGTTCCTTGCGGATTGGCTC-CTGGTGTGATAAATGTTTACGCCGCAGCTGTTGAAGCG-ATTTGGGCAAGCTCCTAACCGTCTCGATATTGAGAGACAGCTTTTTGAACATGACAT
....((...((((((..((((((.(..----).)))))..).)).))))..))(((((...(((((..((......))))))).)))))..........((((((..(((.(((....(((.(.-.(((((((((....))).))))))..)))).....)))-....))))))))).......(((((........)))))...................
CBCs: ____________________________________________________________________((______))_______________________________________________________________________________________________________________________________________________
HCBCs: _____________(_____________________________)__________________((((____________))))_____________________(______________((__(___(_____(________)______)__)_))_________________)________________________________________________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 78.947
II: 92.308
III: 92.593
IV: 100
|
| Annotation |
Process: Mixed HMM and Genbank annotation
Start: 352
End: 566
|
