GI |
10637998  |
Accession |
AJ272400 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetidae ; Boletales ; Suillineae ; Suillaceae ; Suillus ; Suillus aeruginascens
|
Sequence |
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGATAGGGTGCTTGGATACTGGGGGCTGCCGGAGACCTGGACGAAAGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTTAAATGAATCGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCCGAAGTGCATGAATGAATGGTTCCGTGCCTCTAATGCGTCGACGCCTTTTTGGCGTCTTCCTTATTGACTTTTGA |
Structure |
.........(((((((((.((((......)))).)))).).)))).....(((((..(((.(((.(((((((....))))))).))).))).)))))..........(((..((((..((((((((..(((((((..(..(((....((((((((....)))).)))).))))..)))))))..)))).)))))))))))..(((((.(..((((((.....)))))))....)))))........ |
Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-81.7 kcal/mol |
Model |
176063 |
Alignment |
Sbjct: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAAAGGGTGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGATCTGGACTTCTCGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGAATGGGCCTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCTGAAGTGCATGAATGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGTGTCGATGCC-TTCTGGCGTCTTCCTTATTGACTTTTGA .........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(((((((.....))))))).))).))).))))).........((((..((((..((((((((..(((((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))))..)))).)))))))))))).(((((....((((((-....)))))).....)))))........ Query: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGATAGGGTGCTTGGATACTGGGGGCTGCCGGAGACCTGGACGA-AAGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTTAAATGAATCGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCCGAAGTGCATGAATGAATGGTTCCGTGCCTCTAATGCGTCGACGCCTTTTTGGCGTCTTCCTTATTGACTTTTGA .........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(((((((..-..))))))).))).))).)))))..........(((..((((..((((((((..(((((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))))..)))).)))))))))))..(((((....((((((.....)))))).....)))))........ CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _________________________________________________________________(_________________)___________________________________(_____________________(______________________________)____________________)____________________(___________)____________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 100 III: 97.059 IV: 100 |
Model for |
root

| cellular organisms

Eukaryota

Fungi/Metazoa group

Fungi

environmental samples

uncultured ectomycorrhizal fungus

|
| Dikarya

Basidiomycota

Agaricomycotina

Agaricomycetes

Agaricomycetidae

Boletales

Suillineae

Suillaceae

Suillus

Suillus pictus

|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 399
End: 644 |