GI |
85700696  |
Accession |
DQ351501 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetidae ; Boletales ; Suillineae ; Suillaceae ; environmental samples ; uncultured Suillaceae
|
Sequence |
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAGCGGGTGCTTGGATGGTGGGGGCTGCCGGAGACCTGGATTCGTTCAGGACTCGGGCTCCTCTGAAATGAATTGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGTGCACGACAGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGAGTCGACGCCTTCTGGCGTCTTCCNTATCGACGTTT |
Structure |
.........((((((((.(((((......))))).))).).)))).....(((((..(((.(((.((((((....)))))).))).))).)))))..........(((..((((..((((((((..(.(((((..(..(((....((((((((....)))).)))).))))..))))).).).))).)))))))))))..(.(((...(((((((....))))))....)))).)...... |
Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-64.5 kcal/mol |
Model |
176063 |
Alignment |
Sbjct: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAAAGGGTGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGATCTGGACTTCTCGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGAATGGGCCTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCTGAAGTGCATGAATGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGTGTCGATGCCTTCTGGCGTCTTCCTTATTGACTTTTGA .........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(((((((.....))))))).))).))).))))).........((((..((((..((((((((..(((((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))))..)))).)))))))))))).(((((....((((((....)))))).....)))))........ Query: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAGCGGGTGCTTGGATGGTGGGGGCTGCCGGAGACCTGGA---TTCGTTCAGGACTCGGGCTCCTCTGAAATGAATTGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGTGCACGACAGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGAGTCGACGCCTTCTGGCGTCTTCCNTATCGACGTTT-- .........((((.(((..((((......))))..)))...)))).....(((((..(((.(((.((((((---....)))))).))).))).)))))..........(((..((((..(((((((...(.(((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...))))).)...))).)))))))))))..(.(((....((((((....)))))).....))).)......-- CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ____________________________________________________((___________(__((_________))__)__________))_____________________________________________(_______(_________________)____)_________________________________________(__________)____________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 91.667 II: 94.444 III: 91.176 IV: 90.909 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 338
End: 578 |