GI |
86610840  |
Accession |
DQ365643 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetidae ; Boletales ; Suillineae ; Suillaceae ; Suillus ; Suillus lakei
|
Sequence |
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGTTTCGAGCGGGCGTTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGACCTGGATTTATTTCGGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGCATCGGCTTGCGGTTGACTTTCGACTTTGCANGACAAGGCCTTCGGCGTGATAATGATCGTCGTTAGCTGAAGTGCATGAATGAACCGTCCTGCGCCTCTAATACGTCGACGCTTTCCAGCGTCTTCCTTATTGACGTTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-60.1 kcal/mol |
Model |
176063 |
Alignment |
Sbjct: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAAAGGGTGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGATCTGGACTTCTCGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGAATGGGCCTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCTGAAGTGCATGAATGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGTGTCGATGCCTTCTGGCGTCTTCCTTATTGACTTTTGA .........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(((((((.....))))))).))).))).))))).........((((..((((..((((((((..(((((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))))..)))).)))))))))))).(((((....((((((....)))))).....)))))........ Query: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGTTTCGAGCGGGCGTTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGACCTGGATTTAT--TTCGGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGCATCGGCTTGCGGTTGACTTTCGACTTTGCANGACAAGGCCTTCGGCGTGATAATGATCGTCGTTAGCTGAAGTGCATGAATGAACCGTCCTGCGCCTCTAATACGTCGACGCTTTCCAGCGTCTTCCTTATTGACGTTTGA .........((((.(((..((((......))))..)))...)))).....(((((..(((.(((.((((((.....--)))))).))).))).)))))..........(((..((((..(((.((((..(.((((......(((....((((((((....)))).)))).)))....)))).)..))))..))))))))))..(((((....((((((....)))))).....)))))........ CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________(____)_______________________ HCBCs: _________________________________________________________________(_(((_________)))_)_____________________________(_(_________________________________(_________________)___________________________)_)_________(______(__________)_______)____________ |
Transferred percentage of helices |
I: 91.667 II: 94.444 III: 88.235 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 393
End: 636 |