| GI |
87115957  |
| Accession |
DQ367917 |
| Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root  ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetidae ; Boletales ; Suillineae ; Suillaceae ; Suillus ; Suillus lakei
|
| Sequence |
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGTTTCGAGCGGGCGTTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGACCTGGATTTATTTCGGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGCATCGGCTTGCGGTTGACTTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTCGGCGTGATAATGATCGTCGTTAGCTGAAGTGCATGAATGAACCGTCCTGCGCCTCTAATACGTCGACGCTTTCCAGCGTCTTCCTTATTGACGTTTGA |
| Structure |
.........((((((((.(((((......))))).))).).)))).....(((((..(((.(((.((((((.....)))))).))).))).)))))..........(((..((((..(((.((((..(.(((((..(..(((..(.((((((((....)))).)))))))))..))))).)..))))..))))))))))..(((((.(..((((((....)))))))....)))))........ |
| Method |
2: Homology modeled |
| Energy |
-62.4 kcal/mol |
| Model |
176063 |
| Alignment |
Sbjct: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAAAGGGTGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGATCTGGACTTCTCGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGAATGGGCCTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCTGAAGTGCATGAATGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGTGTCGATGCCTTCTGGCGTCTTCCTTATTGACTTTTGA
.........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(((((((.....))))))).))).))).))))).........((((..((((..((((((((..(((((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))))..)))).)))))))))))).(((((....((((((....)))))).....)))))........
Query: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGTTTCGAGCGGGCGTTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGACCTGGATTTAT--TTCGGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGCATCGGCTTGCGGTTGACTTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTCGGCGTGATAATGATCGTCGTTAGCTGAAGTGCATGAATGAACCGTCCTGCGCCTCTAATACGTCGACGCTTTCCAGCGTCTTCCTTATTGACGTTTGA
.........((((.(((..((((......))))..)))...)))).....(((((..(((.(((.((((((.....--)))))).))).))).)))))..........(((..((((..(((.((((..(.(((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...))))).)..))))..))))))))))..(((((....((((((....)))))).....)))))........
CBCs: _________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________(____)_______________________
HCBCs: _________________________________________________________________(_(((_________)))_)_____________________________(_(_________________________________(_________________)___________________________)_)_________(______(__________)_______)____________ |
| Transferred percentage of helices |
I: 91.667
II: 94.444
III: 91.176
IV: 100
|
| Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 432
End: 675
|
