GI |
9937470  |
Accession |
AF289931 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Russulales ; Bondarzewiaceae ; Heterobasidion ; Heterobasidion annosum species complex ; Heterobasidion annosum
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Sequence |
GTGAAATTCTCAACCCTGCGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTTGCTGGTCCTCGCGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGGTAACGCCGCGATTGTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAACTTTATCGAAAC |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-49.5 kcal/mol |
Model |
76786575 |
Alignment |
Sbjct: GTGAAATTCTCAACCC--CGTCTTCTTTYTTGAAGAGCGGAGG-TTGGACTTGGAGGTCGTTGCCGGTCCTTTTGTGATCGGCTCCTCTGGAATGCATTAGCGAGACCCTTGCGGTGGCG-CCTTGGTGTGATAATTGTCTACGCCATGGAC-GTGCCGCGATTTCATGGGGCGCTCGCTTCGAACCGTCGCAAGACACTTTCATCGAACC .........(((((((--(((((((......))))).))).))-))))..(((((((.....(((((((.......))))))).)))))))........((((((.(((((((((((.((-((.(((((((((....))).)))))).)).)-)))))))))......)))...))))))((((...(((....))).......))))... Query: GTGAAATTCTCAACCCTGCGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGG-CTTTGCTGGTCCTCGCG-GATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGGTAACGCCGCGATT--GTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAACTTTATCGAAAC .........((((((...((.((((......))))..))..)).))))..(.(((((-....(((((((......-))))))).))))).)........((((.(.(((((((((((..(.((.(((((((((....))).)))))).)).)..))))))))..--..)))...).))))((.(...(((....))).......).))... CBCs: ________________________(______)____________________________________________________________________________________________(_____________________)________________________________________________________________ HCBCs: _____________________(____________)_______________(_____________(_______________)_________)___________(_________(___(__(_______________________________)__)___)_________________)__________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 85.714 II: 92.857 III: 93.333 IV: 85.714 |
Annotation |
Process: Mixed HMM and Genbank annotation
Start: 342
End: 548 |