GI |
9965357  |
Accession |
AF289932 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Russulales ; Bondarzewiaceae ; Heterobasidion ; Heterobasidion insulare
|
Sequence |
GTGAAATTCTCAACCCTGTGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTTGCTGGTCCTTGCGGATCAGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGTGGTGCGCCGCGATTGTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAACTTTATCGAAAC |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-33.2 kcal/mol |
Model |
315270466 |
Alignment |
Sbjct: ATTTAACTTCTCAACCACGTTGGATATTAATCTTTTCAATGTTGGCTTGGATGTGGGGGTTGTTTGCAGGCTTTTTGTAACAAAAAGGTCGGCTCCCCTGAAATATATTAGTGGTATCTGAG-GCTATTGCTATTAGGTGTGATAATTATCTATGCCTTTTGGGTATGCCGCATGAACAGATTACACTGCTTCTAAC-----GAAAACTATTTTGATGAATTTGA .....((.((.(((((((((((((..........))))))).))).))))).))(((((......((.((((((((......)))))))).)).))))).........(((((..(((((.(-((...((((...(((((((((....))).))))))....)))).))).......)))))..))))).(((...(-----((((....)))))..)))..... Query: -GTGAAATTCTCAACCCTGTGCTTTTCTTGTGAAAGC-GCGTGGGCTTGGACTTGGAGGC--TTTGCTGGTCCTT--------GCGGATCAGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCGCC-CCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGTGGTGCGCCGCGATTGTGGGGGAC-CTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAACTTTATCGAAAC--- -....((.((.(((((((((..((..........)).-))).))).))))).))(((((.--...((.(((((.(--------).))))).)).))))).........(((.(...(((..(.(....((((-..(((((((((....))).))))))....))))..))........)))...)-))).(((.........((((....))))...)))..--- CBCs: ______(_________(_____((__________))______)_________)___(_____________(_(____________)_)________)___________________(_(_________(______(_____________________)_______)____________)_)________________________(____)______________ HCBCs: _________________(((__________________)))______________________________(__(________)__)____________________________________________(_______(___(____)____)________)_______________________________________(__________)___________ |
Transferred percentage of helices |
I: 88.235 II: 86.667 III: 84.615 IV: 87.5 |
Annotation |
Process: Mixed HMM and Genbank annotation
Start: 357
End: 564 |