GI |
14716940  |
Accession |
AJ313491 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Viridiplantae ; Streptophyta ; Streptophytina ; Embryophyta ; Tracheophyta ; Euphyllophyta ; Spermatophyta ; Magnoliophyta ; eudicotyledons ; core eudicotyledons ; rosids ; fabids ; Fabales ; Fabaceae ; Papilionoideae ; Crotalarieae ; Crotalaria ; Crotalaria glaucoides
|
Sequence |
CCATCGTTGCCCTAGTGACTTGGCCTCGTGCTAGGCATCGAGCTGGGCGAATGCTGGCTTCCCGCGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGTAGGGAGTCGTGACGGATGGTGGTGAGTAAAAGAAAGCTCGAGATCCATCGTTGGTGTCACCCGCACCGGCATTGCGACTCTATGATCCATTAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACGG |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-33.1 kcal/mol |
Model |
14717021 |
Alignment |
Sbjct: GCCCATCGTTGCCCCGTTGCTTTGGCCTCGTGCTAGGCACCGAGCTGGGCGAATGCTGGCTTCCCGCGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAATTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGGCGCCGTGACGGGATGGTGGTTGTTGAGTTAAAAGAAAGCTCGAGACCCATCGTGGGTGTCATGCGCACCGGCATTGCGACTCTGTGATCCATGAGCGTCTCTTGGTCGCCCAAGACGG ((((((((.((((.....((..((....)).))..)))).)))..)))))...((((.((.....)).))))((((.(((.((...((((......(((((.((((((..((...((((.((((((..(((((((...(((((((.......)))))))...)))))))...)))))))))).))..)))))))))))..)))))).))))))).((((((....))))))... Query: --CCATCGTTGCCCTAGTGACTTGGCCTCGTGCTAGGCATCGAGCTGGGCGAATGCTGGCTTCCCGCGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGTAG---GGAGTCGTGAC-GGATGGTGG----TGAG-TAAAAGAAAGCTCGAGATCCATCGTTGGTGTCACCCGCACCGGCATTGCGACTCTATGATCCATTAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACGG --((((((.((((.....(...((....))..)..)))).)))..))).....((((.((.....)).))))((((.(.(.((...((((......(((((.((((((..(---.(.(..(((((-..(((((((----((((-(.......).))))....)))))))....))))).).)..)..)))))))))))..)))))).).))))).(.((((....)))).)... CBCs: __________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ________________________________________________________________________________________________________________________(________________________________________________________)________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 81.25 II: 100 III: 86 IV: 83.333 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 248
End: 24 |