GI |
150035551  |
Accession |
EF619768 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetidae ; Boletales ; Suillineae ; Suillaceae ; environmental samples ; uncultured Suillus
|
Sequence |
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGACAGGGCGCTTGGATGTTGGGGGCTGCCGGAGACACTGGATTCGTCCAGGACTCGGGCTCCTCTTAAATGAATCGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTTTGCGCGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGTGCAAGACAGAACGGTCCCGTGCCTCTAATGCGTCGACGCCTCTCGGGGCCGTCTTCCTCATTGACGTTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-65 kcal/mol |
Model |
176063 |
Alignment |
Sbjct: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAAAGGGTGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGAT-CTGGACTTCTCGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGAATGGGCCTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCTGAAGTGCATGAATGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGTGTCGATGCCTTCTGG---CGTCTTCCTTATTGACTTTTGA .........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(-((((((.....))))))).))).))).))))).........((((..((((..((((((((..(((((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))))..)))).)))))))))))).(((((....((((((....))---)))).....)))))........ Query: AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGACAGGGCGCTTGGATGTTGGGGGCTGCCGGAGACACTGGA---TTCGTCCAGGACTCGGGCTCCTCTTAAATGAATCGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTTTGCGCGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGTGCAAGACAGAACGGTCCCGTGCCTCTAATGCGTCGACGCCTCTCGGGGCCGTCTTCCTCATTGACGTTTGA .........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(.(((((---....)))))).))).))).)))))..........(((..((((..(((((((...(((((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))))...))).)))))))))))..(((((....((((((....))...)))).....)))))........ CBCs: ___________________________________________________________________________________________________________________________________(__________________________________________________)___________________________________________________________________ HCBCs: ____________________________________________________((___________(___(___________)__)__________))______________________________________((_____(_______(_________________)____)___))_____________________________(______(_____________)_______)____________ |
Transferred percentage of helices |
I: 100 II: 94.444 III: 94.118 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 365
End: 611 |