GI |
1518677  |
Accession |
U60605 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Cnidaria ; Anthozoa ; Hexacorallia ; Scleractinia ; Faviina ; Faviidae ; Montastraea ; Montastraea franksi
|
Sequence |
GGATATCATCCATCGCAGCCAAAAACTTGCCGGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCACCCAGTGGGAGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGGCAGAGAGACTCACTGCGGTTGCCGGGTTCTTCCCGCGGCACACCAGCGGAGGCTAAAAGTGTGACCAGTCCTTCGCGTGCCGTCGGGTGCCCGCCGCTCGAGTCGCGGAGGCGAAGCATACCTTCTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-72.2 kcal/mol |
Model |
2827041 |
Alignment |
Sbjct: ----ATCATCCATCGCAGGCAAAAACTTGCCGGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCACCCAGTGGGAGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGGCAGAGAGACTCACTGCGGTTGCCGGGTTTTTCCCGCGGCACACCAGCGGAGGCTAAAAGTGTGACCAGTCCTTCGCGTGCCGTCGGGTGCCCGCCGCTCGAGTCGCGGAGGCGAAGCATACCTTC---- ----.........(((.(((((....))))).)))((.((((((...(((((((.(((...)))...)))))))..))))))...)).....(((((...(((((....((((....((((((((((....(((((((((............)).))))))))))))).)))).)))))))))..)))))..(((((.........)))))---- Query: GGATATCATCCATCGCAGCCAAAAACTTGCCGGCGGCGTTGAGGCGTCACGGCCACCCAGTGGGAGCGGCCGTGTCCCTTGAAAGGCAGAGAGACTCACTGCGGTTGCCGGGTTCTTCCCGCGGCACACCAGCGGAGGCTAAAAGTGTGACCAGTCCTTCGCGTGCCGTCGGGTGCCCGCCGCTCGAGTCGCGGAGGCGAAGCATACCTTCTTGA .............(((.(.(((....))).).)))((.((((((...(((((((.(((...)))...)))))))..))))))...)).....(((((...(((((....((((....((((((((((....(((((((((............)).))))))))))))).)))).)))))))))..)))))..(((((.........))))).... CBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: _______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 87.5 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 438
End: 652 |