GI |
220967506  |
Accession |
EU977229 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; unclassified Fungi ; fungal endophyte sp. P1921A
|
Sequence |
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTCTTTACAGGTTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-47.6 kcal/mol |
Model |
148807690 |
Alignment |
Sbjct: ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTCGACGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTTCA-AGGTTGA ....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((.((((((.(((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))....))))))....)))...(((((.....-.))))). Query: ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAAC-TAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTCTTTACAGGTTGA ....(((...((((((...))))))..)))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((.((((((.(((...((((.((((.((..((-....))))))))..)))))))))))))....))))))....)))...(((((.......))))). CBCs: ____________________________________(___________)_____________________________________________________________________________________________________________________ HCBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 90 II: 100 III: 100 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 354
End: 518 |