GI |
1101868  |
Accession |
U19950 |
Date |
2011/04/01 |
Lineage  |
root ; cellular organisms ; Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Fungi ; Dikarya ; Basidiomycota ; Agaricomycotina ; Agaricomycetes ; Agaricomycetes incertae sedis ; Cantharellales ; Ceratobasidiaceae ; Thanatephorus ; Thanatephorus cucumeris
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Sequence |
ATGAAATTCTCAAAGAAACCTTTTGTTAATTCAACTGGCCTTGCTTTGGACTTGGAGGTCTTGCAGATGTCACAGTCTGCTCCTCTTAAATAATTAGCTGGATCTCGTATACACTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGTATCACTCGCTGAGGACACTGTAAAAGGTGGCCAGGCAATCAGATGAACCGCTTCTAATAGTCCATTCACTTGGACAATTACACTTATGATCTGA |
Structure |
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Method |
2: Homology modeled |
Energy |
-30.3 kcal/mol |
Model |
83272313 |
Alignment |
Sbjct: ATGAAATCCTCAAAATAAATCTTTTGTTAATTCAACTGG-TTTACTTTGGACTTGGAGGTCTTTGCAGATTTCAC-GTCTGCTCCTCTTAAATGCATTAGCTGGATCT-GTATGAACTCGGTTCCACTCGGCGTGATAAGTATCACTCGCTGAGGACACTGTAAAAGG-GGCCGGG-ATTATTATGAACCGCTTCTTAATAGTCCATTGACTTGGACAAAC-TACTTATGATAT-- .........(((((.((((((....(((.....))).))-)))).)))))....(((((.....((((((.....-)))))).)))))..........(((.((.((.-..((((.(((((((((.(((((((.(((....)))...)))))))............))-)))))))-.))))...)).)))))........(((((......)))))....-............-- Query: ATGAAATTCTCAAAG-AAACCTTTTGTTAATTCAACTGGCCTTGCTTTGGACTTGGAGGTC-TTGCAGATGTCACAGTCTGCTCCTCTTAAATA-ATTAGCTGGATCTCGTATACACTTGGTTCCACTCGGCGTGATAAGTATCACTCGCTGAGGACACTGTAAAAGGTGGCCAGGCAATCAGATGAACCGCTTC-TAATAGTCCATTCACTTGGACAATTACACTTATGATCTGA .........(((((.-((.((....(((.....))).))..))..)))))....(((((..-..((((((......)))))).)))))......-...(((.((.((......(..(((((((((.(((((((.(((....)))...)))))))............)).)))))))...).....)).)))))..-.....(((((......)))))................... CBCs: ______________________________________________________________________________________________________________________(______________________________________________________)______________________________________________________________ HCBCs: ___________________(__________________)__________________________________________________________________________(_________________________________________________________________)________________________________________________________ |
Transferred percentage of helices |
I: 85.714 II: 100 III: 90 IV: 100 |
Annotation |
Process: HMM annotation
Start: 325
End: 556 |